Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C17orf58Q2M2W7 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms