Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RTL8BQ17RB0 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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