Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
IMPG1Q17R60 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms