Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
GABRA6Q16445 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms