Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PRR4Q16378 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms