Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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CBFBQ13951 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CBFBQ13951 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CBFBQ13951 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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