Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTCH1Q13635 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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