Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TMC2-201ENST00000358864 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ZNF75D-201ENST00000370764 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TBC1D27-201ENST00000261651 4838 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 COLQ-203ENST00000383788 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AC009078.3-201ENST00000624205 4084 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ZBTB1-203ENST00000554015 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PIGM-201ENST00000368090 4319 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AC106820.4-201ENST00000561847 5616 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 KIRREL1-201ENST00000359209 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 LINC00452-202ENST00000609661 2896 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 LINC02052-202ENST00000427914 2285 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AC073476.3-201ENST00000563949 2507 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 MAB21L2-201ENST00000317605 2772 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PAX6-208ENST00000379132 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ZNF461-204ENST00000588268 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 DENND2A-210ENST00000537639 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PDLIM5-210ENST00000508216 1794 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 FAM78A-202ENST00000372269 3659 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 OSBP2-204ENST00000407373 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CRP-201ENST00000255030 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 KLK10-203ENST00000391805 3006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 LOXL2-201ENST00000389131 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 TFIP11-204ENST00000407690 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 MAP2K6-206ENST00000590474 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AP003355.2-201ENST00000605923 2622 ntBASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 ACSL1-210ENST00000513317 2469 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PLEKHG3-204ENST00000484731 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 COLQ-201ENST00000383781 2784 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2V1Q13404 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms