Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms