Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms