Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL161725.1-203ENST00000415004 1081 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LHFPL3-AS1-206ENST00000449764 1196 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 UTP23-203ENST00000517820 796 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC083841.1-201ENST00000523657 670 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 BRIX1P1-201ENST00000521785 908 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC025423.1-201ENST00000544710 374 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms