Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms