Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRXP46100 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRXP46100 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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