Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJC1P36383 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GJC1P36383 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms