Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H1P32780 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms