Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRMP28827 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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PTPRMP28827 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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PTPRMP28827 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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