Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
IL3RAP26951 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms