Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2AP24928 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms