Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBA1P22314 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA1P22314 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA1P22314 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA1P22314 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA1P22314 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA1P22314 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA1P22314 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA1P22314 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA1P22314 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA1P22314 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA1P22314 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA1P22314 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA1P22314 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBA1P22314 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBA1P22314 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA1P22314 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA1P22314 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA1P22314 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA1P22314 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA1P22314 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA1P22314 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA1P22314 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBA1P22314 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA1P22314 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBA1P22314 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms