Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4BP0C0L5 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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