Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GLI1P08151 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GLI1P08151 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GLI1P08151 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms