Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTMAP06454 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTMAP06454 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTMAP06454 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTMAP06454 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTMAP06454 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTMAP06454 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTMAP06454 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTMAP06454 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTMAP06454 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTMAP06454 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTMAP06454 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms