Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB3P05106 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB3P05106 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms