Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POMCP01189 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POMCP01189 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMCP01189 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMCP01189 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POMCP01189 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMCP01189 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMCP01189 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMCP01189 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMCP01189 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMCP01189 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms