Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPQQ9Y646 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPQQ9Y646 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPQQ9Y646 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms