Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CLDN16Q9Y5I7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN16Q9Y5I7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms