Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F0

PCDHB13, Protocadherin beta-13, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB13Q9Y5F0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB13Q9Y5F0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB13Q9Y5F0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB13Q9Y5F0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB13Q9Y5F0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB13Q9Y5F0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB13Q9Y5F0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB13Q9Y5F0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB13Q9Y5F0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHB13Q9Y5F0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB13Q9Y5F0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms