Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKAB1Q9Y478 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKAB1Q9Y478 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAB1Q9Y478 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms