Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKP3Q9Y446 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKP3Q9Y446 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKP3Q9Y446 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms