Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C5

RNF11, RING finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF11Q9Y3C5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF11Q9Y3C5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF11Q9Y3C5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF11Q9Y3C5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF11Q9Y3C5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF11Q9Y3C5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF11Q9Y3C5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF11Q9Y3C5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF11Q9Y3C5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF11Q9Y3C5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms