Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED7Q9Y3B3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED7Q9Y3B3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms