Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZDHHC9Q9Y397 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZDHHC9Q9Y397 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms