Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP3Q9Y2W7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP3Q9Y2W7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms