Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHDC2Q9Y2U9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms