Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP3M1Q9Y2T2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3M1Q9Y2T2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP3M1Q9Y2T2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms