Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL20Q9Y2M5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL20Q9Y2M5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL20Q9Y2M5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL20Q9Y2M5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL20Q9Y2M5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms