Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFR3BQ9Y2G0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFR3BQ9Y2G0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFR3BQ9Y2G0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFR3BQ9Y2G0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFR3BQ9Y2G0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFR3BQ9Y2G0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFR3BQ9Y2G0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFR3BQ9Y2G0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EFR3BQ9Y2G0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFR3BQ9Y2G0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFR3BQ9Y2G0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms