Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM35Q9UPQ4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM35Q9UPQ4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM35Q9UPQ4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms