Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX12Q9UMY4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX12Q9UMY4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms