Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP17Q9ULZ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP17Q9ULZ9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP17Q9ULZ9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms