Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DENND2AQ9ULE3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DENND2AQ9ULE3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DENND2AQ9ULE3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms