Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NRXN1Q9ULB1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NRXN1Q9ULB1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NRXN1Q9ULB1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NRXN1Q9ULB1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
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