Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DSEQ9UL01 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSEQ9UL01 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms