Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC9Q9UKV0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
HDAC9Q9UKV0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HDAC9Q9UKV0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms