Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN16Q9UKR8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSPAN16Q9UKR8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN16Q9UKR8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms