Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM4Q9UKN5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM4Q9UKN5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM4Q9UKN5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms