Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK6

NXT1, NTF2-related export protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXT1Q9UKK6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NXT1Q9UKK6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXT1Q9UKK6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms