Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC13A4Q9UKG4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC13A4Q9UKG4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms