Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GGA1Q9UJY5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GGA1Q9UJY5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GGA1Q9UJY5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms