Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGA2Q9UJY4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGA2Q9UJY4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms